Счетная палата Ханты-Мансийского автономного округа - Югры является постоянно действующим органом внешнего государственного финансового контроля Ханты-Мансийского автономного округа - Югры, образуемым Думой Ханты-Мансийского автономного округа - Югры  и подотчетным ей.
Счетная палата обладает организационной и функциональной независимостью, осуществляет свою деятельность самостоятельно.
Деятельность Счетной палаты не может быть приостановлена, в том числе в связи с истечением срока или досрочным прекращением полномочий Думы автономного округа.
Счетная палата является государственным органом Ханты-Мансийского автономного округа - Югры, обладает правами юридического лица, имеет гербовую печать и бланки со своим наименованием и с изображением герба Ханты-Мансийского автономного округа - Югры.